RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Chmp1b1Q99LU0 199 aa12.01□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Uck2Q99PM9 261 aa12.01□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NepnQ9CQ76 512 aa12.01□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1508Q9R0K4 310 aa12.01□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pgbd5D3YZI9 523 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr891E9Q843 316 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Capns1O88456 269 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TpbpaP13438 124 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Acod1P54987 488 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Adra1bP97717 514 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bmp1P98063 991 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fads2p1Q0VAX3 487 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdkl4Q3TZA2 342 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dcdc2Q5DU00 475 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ltbp3Q61810 1268 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arl15Q8BGR6 204 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tspan12Q8BKT6 305 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam46bQ8C152 427 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gramd1cQ8CI52 457 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdc123Q8CII2 336 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fads1Q920L1 447 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TrilQ9DBY4 809 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Csnk1dQ9DC28 415 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hey1Q9WV93 299 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CrnnD3YUU6 520 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm21319F6YNI8 144 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lman2lP59481 347 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 InhbbQ04999 411 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sox4Q06831 440 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PrtgQ2EY15 1191 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fbxw18Q3TSA9 469 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc26a10Q5EBI0 492 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Utp4Q8R2N2 686 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Adap2Q8R2V5 381 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1052Q8VGR8 312 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam13cQ9DBR2 601 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4930595M18RikA2RRY9 829 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr742A2RTP5 311 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ttll2A4Q9E4 540 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4930402K13RikB1AW18 415 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn1r58G3X9U3 310 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rnpepl1G5E872 720 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Foxq1O70220 400 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Klk1b16P04071 261 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tk1P04184 233 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd9P40240 226 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 VaspP70460 375 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cpt1aP97742 773 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PrkczQ02956 592 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 InhaQ04997 366 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr681Q3SXH8 315 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mup20Q5FW60 181 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bcap29Q61334 240 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 VclQ64727 1066 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ManealQ6P1J0 452 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sra1Q80VJ2 232 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc39a9Q8BFU1 308 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tusc3Q8BTV1 347 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mettl3Q8C3P7 580 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 FevQ8QZW2 237 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tsen15Q8R3W5 168 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1469Q8VFW5 309 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr679Q8VGV0 315 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Spg21Q9CQC8 308 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cypt12Q9DAR6 119 aa12□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm20695H3BLK7 282 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Efna3O08545 230 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ulk1O70405 1051 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Clcn7O70496 803 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cxcr4P70658 359 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ankrd42Q3V096 527 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Adam2Q60718 735 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr538Q7TRT5 310 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Znf516Q7TSH3 1157 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp184Q7TSH9 737 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zik1Q80YP6 463 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Serpina11Q8CIE0 424 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Grip1Q925T6 1127 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Col25a1Q99MQ5 666 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Moxd1Q9CXI3 613 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CenpnQ9CZW2 337 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sec23bQ9D662 767 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Aldh9a1Q9JLJ2 494 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cpne6Q9Z140 557 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Brca1P48754 1812 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd300ld4A2A7W1 245 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tsga10ipF7A1F0 157 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr631F8VPJ9 319 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zw10O54692 779 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CkmP07310 381 aa11.99□□□□□ -0.49
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tbx1P70323 479 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms