RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas2r117Q7M715 330 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr744Q7TRM0 323 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem202Q80W35 275 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 McubQ810S1 345 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ostm1Q8BGT0 338 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CcsapQ8QZT2 252 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr821Q8VG45 310 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Barhl2Q8VIB5 384 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ferd3lQ923Z4 168 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msantd3Q9CR78 275 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9D9D9 101 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rsph9Q9D9V4 276 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nlrc5C3VPR6 1915 aa9.52□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd300ld4A2A7W1 245 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930455H04RikD3Z622 58 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnih2O35089 160 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tcf3P15806 651 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CratP47934 626 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nanos3P60324 178 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atf4Q06507 349 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SypQ62277 314 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nptx1Q62443 432 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas2r39Q7TQA5 319 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Luzp2Q8BGY3 345 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pqlc3Q8C6U2 202 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Castor2Q8CAB8 329 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc43a2Q8CGA3 568 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r199Q8R280 367 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1387Q8VFA9 311 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klk6Q91Y82 253 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uck2Q99PM9 261 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gemin2Q9CQQ4 269 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kif12Q9D2Z8 642 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7929A0A286YDV3 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aadacl2B2RWD2 401 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FanceB8JJD6 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7945F6QI24 236 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21977F6U3N7 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8247F6VRJ8 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8005F6YKY3 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3015F6ZAP6 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8212F6ZMY5 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7954F7BAX1 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8138F7BY56 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8232F7CFJ3 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17079F7D8Y4 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5152L7N200 190 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8165L7N218 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8122L7N2C7 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17078M0QW51 211 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcne1P23299 129 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gp1bbP56400 206 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Naa11Q3UX61 218 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MeikinQ5F2C3 434 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mep1bQ61847 704 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Svs1Q6WIZ7 820 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nlgn3Q8BYM5 825 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dleu7Q8CHZ8 209 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc38a1Q8K2P7 485 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Blzf1Q8R2X8 403 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nae1Q8VBW6 534 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Paip1Q8VE62 400 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr357Q8VFP4 308 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl22Q99JN2 634 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl28Q9CR40 571 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9CWU4 180 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EbplQ9D0P0 206 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cst11Q9D269 139 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr704Q9EPF6 315 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dkk3Q9QUN9 349 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sema6cQ9WTM3 931 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Epm2aQ9WUA5 330 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr49Q9Z1V0 313 aa9.52□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ankrd60A2AMD2 318 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1425K7N659 312 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GypaP14220 168 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SPINDOCQ05AH6 381 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nell1Q2VWQ2 810 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-Q2Q4KN81 360 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bcar1Q61140 874 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1197Q7TR13 314 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1196Q7TR14 314 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ube2q1Q7TSS2 422 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8R3C1 574 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ing3Q8VEK6 421 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc35b3Q922Q5 369 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gorasp2Q99JX3 451 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snx29Q9D3S3 818 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abcb10Q9JI39 715 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Deaf1Q9Z1T5 566 aa9.51□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2afb1S4R1E0 115 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.4 ms