RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DOHH	Q9BU89	302 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RFXANK	O14593	260 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PPEF2	O14830	753 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SUV39H1	O43463	412 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LMO2	P25791	158 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IRS1	P35568	1242 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PNPLA4	P41247	253 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RENBP	P51606	427 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MXD1	Q05195	221 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IL18	Q14116	193 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	P2RY14	Q15391	338 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LHX8	Q68G74	356 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BVES	Q8NE79	360 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NELL1	Q92832	810 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DEFB118	Q96PH6	123 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	THSD1	Q9NS62	852 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BCKDHA	P12694	445 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CCR1	P32246	355 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BDKRB1	P46663	353 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MEOX2	P50222	304 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CLCN7	P51798	805 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HMGA2	P52926	109 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MTAP	Q13126	283 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF180	Q86T96	592 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LGI4	Q8N135	537 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CLIC1	O00299	241 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HCRT	O43612	131 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKY	O43930	277 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PEX11B	O96011	259 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GLUD1	P00367	558 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MMP2	P08253	660 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	UGT2B7	P16662	529 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	HLA-DPA1	P20036	260 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	PSMA3	P25788	255 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CD96	P40200	585 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	IL2	P60568	153 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC14A1	Q13336	389 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	USP7	Q93009	1102 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR21	Q99679	349 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CPEB1-215	ENST00000617958	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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