RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 OR4D1Q15615 310 aa23.06■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 OPN5Q6U736 354 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CREG2Q8IUH2 290 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TTYH2Q9BSA4 534 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TBCDQ9BTW9 1192 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 SACM1LQ9NTJ5 587 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 FAM215AQ9Y5M1 114 aa23.06■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 ETHE1O95571 254 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 GLI4P10075 376 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CD1DP15813 335 aa23.05■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V0D1P61421 351 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TBCCQ15814 346 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 RTL6Q6ICC9 239 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 PDPRQ8NCN5 879 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF721Q8TF20 911 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 MS4A8Q9BY19 250 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.05■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 CD1EP15812 388 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CASP2P42575 452 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 DNASE1L1P49184 302 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ID2Q02363 134 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CHIT1Q13231 466 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 MPEG1Q2M385 716 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CLYBLQ8N0X4 340 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 ATG4BQ9Y4P1 393 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 P04436 131 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC10A1Q14973 349 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 PIGGQ5H8A4 983 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM200AQ86VY9 491 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 SPACA6W5XKT8 324 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JNJ9 132 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 ATP6AP2O75787 350 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 STMN1P16949 149 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 CD244Q9BZW8 370 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 SNX24Q9Y343 169 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 COX7A2P14406 83 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 SSTR1P30872 391 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 MAN2A2P49641 1150 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 ART1P52961 327 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 ASPHQ12797 758 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 CHSY3Q70JA7 882 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 LIX1LQ8IVB5 337 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 LAS2Q8IYD9 372 aa23.01■■□□□ 1.27
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