RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598697.5

TRPM4-211, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRPM4, Length 3,349 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-211ENST00000598697 TMEM68Q96MH6 324 aa14.65□□□□□ -0.06
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TRPM4-211ENST00000598697 CAV3P56539 151 aa14.63□□□□□ -0.07
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