RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 SPINK2P20155 84 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 TMEM198Q66K66 360 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 QSOX2Q6ZRP7 698 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 CLNKQ7Z7G1 428 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 NKD1Q969G9 470 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 HEY2Q9UBP5 337 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 NUP210LQ5VU65 1888 aa24.21■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.2■■□□□ 1.47
STIP1-208ENST00000540501 CTNSO60931 367 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 IGHEP01854 428 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.465e-6■■■■■ 39.5
STIP1-208ENST00000540501 PTGR1Q14914 329 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 VWA2Q5GFL6 755 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 C18orf63Q68DL7 685 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FAM47BQ8NA70 645 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PLPP5Q8NEB5 264 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FGF11Q92914 225 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 RNF31Q96EP0 1072 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 EGLN2Q96KS0 407 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 GIMAP4Q9NUV9 329 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ATAD3AQ9NVI7 634 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 TAS2R7Q9NYW3 318 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CTSFQ9UBX1 484 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ATP6V1HQ9UI12 483 aa24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ALDH9A1P49189 494 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 DNASE1L3Q13609 305 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 LCN10Q6JVE6 187 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SLC48A1Q6P1K1 146 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CT55Q8WUE5 264 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CSF3RQ99062 836 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 LANCL2Q9NS86 450 aa24.19■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD28O15084 1053 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SLC22A2O15244 555 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 B4GALT2O60909 372 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SLC22A3O75751 556 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 DCTN3O75935 186 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FURINP09958 794 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PIK3R1P27986 724 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SERTAD2Q14140 314 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 MINDY4Q4G0A6 757 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 OR4K14Q8NGD5 310 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 DNAJB14Q8TBM8 379 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 TESCQ96BS2 214 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PPCDCQ96CD2 204 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SPSB2Q99619 263 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CROTQ9UKG9 612 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa24.18■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 EPG5Q9HCE0 2579 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FAM227AF5H4B4 570 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 HEXBP07686 556 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 DLSTP36957 453 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 FOLR3P41439 243 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SLC13A2Q13183 592 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PDE7AQ13946 482 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CAMKMTQ7Z624 323 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 OR2Y1Q8NGV0 311 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 NACC2Q96BF6 587 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PTCHD1Q96NR3 888 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SEMA3GQ9NS98 782 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 UTS2RQ9UKP6 389 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CES1P1Q9UKY3 287 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 MKL2Q9ULH7 1088 aa24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 DYTNA2CJ06 578 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 AKAP10O43572 662 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 LRATO95237 230 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 GPR75O95800 540 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 COX7A2P14406 83 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 PTPN4P29074 926 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 EMP2P54851 167 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 STX4Q12846 297 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ERV3-1Q14264 604 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 CPTPQ5TA50 214 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 SCUBE1Q8IWY4 988 aa24.16■■□□□ 1.46
STIP1-208ENST00000540501 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms