RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509018.5

RAPGEF6-208, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 8,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-208ENST00000509018 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 CDS1Q92903 461 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 BORCS8Q96FH0 119 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 SGCZQ96LD1 299 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 BATF3Q9NR55 127 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCDC182A6NF36 153 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 M0R3H8 397 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 HTR3BO95264 441 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 GNAZP19086 355 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 LEG1Q6P5S2 330 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FANK1Q8TC84 345 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 SYPP08247 313 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 HK1P19367 917 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 NPR2P20594 1047 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 DPYSL2Q16555 572 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FRG2Q64ET8 278 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FRG2BQ96QU4 278 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 CITED4Q96RK1 184 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 INPP5KQ9BT40 448 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 A0A1W2PPW3 197 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 KLF11O14901 512 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRAMEF12O95522 483 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRR5P85299 388 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 MELKQ14680 651 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 INAVAQ3KP66 663 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 STX12Q86Y82 276 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 J3KTA2 159 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 HSD3B2P26439 372 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PGFP49763 221 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TP53I3Q53FA7 332 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 RFT1Q96AA3 541 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 DPH1Q9BZG8 443 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FOXL2P58012 376 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 C12orf40Q86WS4 652 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 LGR4Q9BXB1 951 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PDP2Q9P2J9 529 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TAF4O00268 1085 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PGRP06401 933 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 IMPDH1P20839 514 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 LTB4RQ15722 352 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 C10orf82Q8WW14 230 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PGAM5Q96HS1 289 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 NRTNQ99748 197 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 TNFAIP8O95379 198 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-208ENST00000509018 MAGEA12P43365 314 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms