RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 SHISA5Q8N114 240 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 NATD1Q8N6N6 113 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 NAT16Q8N8M0 369 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 C12orf29Q8N999 325 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SMPDL3BQ92485 455 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A10Q96PG2 267 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF559Q9BR84 538 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 LDAHQ9H6V9 325 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 POT1Q9NUX5 634 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.88□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.88□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 GRIN2DO15399 1336 aa6.87□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PR48 441 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 KLF11O14901 512 aa6.87□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 SLC43A1O75387 559 aa6.87□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PRRT1Q99946 306 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.87□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.87□□□□□ -1.31
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