RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM225	Q6GV28	225 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TTC27	Q6P3X3	843 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LONP2	Q86WA8	852 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RNF149	Q8NC42	400 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRPV3	Q8NET8	790 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RNF128	Q8TEB7	428 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ITFG2	Q969R8	447 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM45B	Q96B21	275 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPAS2	Q99743	824 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OMD	Q99983	421 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	KXD1	Q9BQD3	176 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MIOS	Q9NXC5	875 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PADI3	Q9ULW8	664 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TTC3	P53804	2025 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARHGEF9	O43307	516 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZIC3	O60481	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LGI1	O95970	557 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TOMM40	O96008	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FGF2	P09038	288 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC11A1	P49279	550 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GEM	P55040	296 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMPRSS3	P57727	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NUCB2	P80303	420 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZXDB	P98169	803 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRDN	Q13061	729 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDH18	Q13634	790 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	EFNB3	Q15768	340 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CTF1	Q16619	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PHKG1	Q16816	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	MIDN	Q504T8	468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	GPAT3	Q53EU6	434 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	LIN9	Q5TKA1	542 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM57B	Q71RH2	274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6	4e-6	■□□□□ 11.2
GIGYF2-238	ENST00000483164	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	HAVCR1	Q96D42	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM210A	Q96ND0	272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPRY4	Q9C004	299 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	WNT16	Q9UBV4	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TINAG	Q9UJW2	476 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANTXRL	A6NF34	631 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164		I6L893	689 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SDHD	O14521	159 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	KLF11	O14901	512 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARPC2	O15144	300 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	DNAJB6	O75190	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDH16	O75309	829 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	CRYGC	P07315	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ALPI	P09923	528 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERVK-10	P10266	1014 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRKACA	P17612	351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	SRD5A2	P31213	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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