RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TAPBPO15533 448 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 HCN1O60741 890 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DIAPH2O60879 1101 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CD99P14209 185 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DNASE1L1P49184 302 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ARL4CP56559 192 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MPEG1Q2M385 716 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CDKL4Q5MAI5 379 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf185Q5T7R7 199 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 F2RL3Q96RI0 385 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 RHOJQ9H4E5 214 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SPACA6W5XKT8 324 aa24.37■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF4O60810 478 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 LDB3O75112 727 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ATP6AP2O75787 350 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NADKO95544 446 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CELA3AP09093 270 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CCL3P10147 92 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 GABRA1P14867 456 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SLC12A2P55011 1212 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DLX5P56178 289 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 LAPTM5Q13571 262 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DOC2AQ14183 400 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF721Q8TF20 911 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.36■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CTAG2O75638 210 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ADH7P40394 386 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PDK4Q16654 411 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PAGE2BQ5JRK9 111 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ARSKQ6UWY0 536 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NUBPLQ8TB37 319 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 B4GALT7Q9UBV7 327 aa24.35■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 STK16O75716 305 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ETHE1O95571 254 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 COX7A2P14406 83 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CD22P20273 847 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PEX19P40855 299 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 HSPA7P48741 367 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 POU4F1Q01851 419 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PIGGQ5H8A4 983 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SULT1C3Q6IMI6 304 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF793Q6ZN11 406 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 UBE3DQ7Z6J8 389 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 GPSM1Q86YR5 675 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SNX31Q8N9S9 440 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 RUNDC3BQ96NL0 473 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 EXO5Q9H790 373 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SCELO95171 688 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ASPHQ12797 758 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A10Q63ZE4 541 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZZZ3Q8IYH5 903 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ACOT4Q8N9L9 421 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A8Q8TCC7 542 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A8Q9BY19 250 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SH2D2AQ9NP31 389 aa24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PIGAP37287 484 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 STT3AP46977 705 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 TBCCQ15814 346 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO48Q5FWF7 155 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SLC15A4Q8N697 577 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PDPRQ8NCN5 879 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PAQR8Q8TEZ7 354 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms