RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL9Q96SU4 736 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM79Q9BSE2 394 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPS2Q9BXY5 557 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EHD1Q9H4M9 534 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDAHQ9H6V9 325 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF358Q9NW07 568 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNHD1Q96M86 4753 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCN1O60741 890 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDB3O75112 727 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNI3P19429 210 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R2AP63151 447 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGM3Q08188 693 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC10A1Q14973 349 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORF4L2Q15014 288 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFBIQ15582 683 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCAIMQ8N3R3 496 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO2A1Q92959 643 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC39Q96DD0 335 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXO5Q9H790 373 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYRM4Q9HD34 91 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM7Q9NQW5 492 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC11Q9NVH1 559 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WWOXQ9NZC7 414 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR3Q9UBC9 169 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALT7Q9UBV7 327 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPS7AQ9UBW8 275 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX264Q9Y6I9 313 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP6Q13023 2319 aa12.16□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCKAP5O14513 1909 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLGNO14967 610 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF4O60810 478 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETHE1O95571 254 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRA1P14867 456 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK2P20151 261 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IVDP26440 423 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGAP37287 484 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNC1P48547 511 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAT5Q09328 741 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPHQ12797 758 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEBPEQ15744 281 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPEG1Q2M385 716 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF793Q6ZN11 406 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUBPLQ8TB37 319 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF721Q8TF20 911 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR34Q96EX3 536 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS39Q96JC1 886 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPZA3Q96KX2 299 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUNDC3BQ96NL0 473 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNC2Q96PR1 638 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F2RL3Q96RI0 385 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNPPD1Q9BV87 410 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROGDIQ9GZN7 287 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIME1Q9H400 295 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POPDC3Q9HBV1 291 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2D2AQ9NP31 389 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPACA6W5XKT8 324 aa12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAPBPO15533 448 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD22P20273 847 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGT5P36269 586 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX19P40855 299 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DL3P43628 341 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA7P48741 367 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ID2Q02363 134 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOC2AQ14183 400 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO48Q5FWF7 155 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGGQ5H8A4 983 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX31Q8N9S9 440 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A8Q8TCC7 542 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB11Q9BUY7 163 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DERL2Q9GZP9 239 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASSF1Q9NS23 344 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRIM1Q9NZV1 1036 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 216.7 ms