RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 ACADLP28330 430 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ARRB2P32121 409 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CCR7P32248 378 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PCGF2P35227 344 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 STARP49675 285 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR52E4Q8NGH9 312 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR51I1Q9H343 314 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MED31Q9Y3C7 131 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR37L1O60883 481 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CELP19835 753 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 HSF2Q03933 536 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC3A1Q07837 685 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF691Q5VV52 312 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CASD1Q96PB1 797 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 JRKO75564 520 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ARL6IP5O75915 188 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CSF2P04141 144 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CNR2P34972 360 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RELAQ04206 551 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 IER5LQ5T953 404 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 EGLN2Q96KS0 407 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF38Q9H0F5 515 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 KLHL31Q9H511 634 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 LHX3Q9UBR4 397 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 EVPLQ92817 2033 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RFPL2O75678 378 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM18P0DKX4 95 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ALPPL2P10696 532 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CCL5P13501 91 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 AKT2P31751 481 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 DSC1Q08554 894 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 KCT2Q8NC54 265 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB7BQ96AH8 199 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM19Q96HH6 336 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GSTT2BP0CG30 244 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ATF6P18850 670 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SHMT2P34897 504 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 WACQ9BTA9 647 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 J3QLW9 94 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF19P17023 458 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CSNK1DP48730 415 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CLCN7P51798 805 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MPP7Q5T2T1 576 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 XKR8Q9H6D3 395 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ANHXE9PGG2 379 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR7A17O14581 309 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 IFI30P13284 250 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF24P17028 368 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ALDH3B2P48448 385 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MAB21L1Q13394 359 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PNCKQ6P2M8 343 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 LRR1Q96L50 414 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 LIPT1Q9Y234 373 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 APOL3O95236 402 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ALAS2P22557 587 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PGDP52209 483 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC115Q96NT0 180 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 STUB1Q9UNE7 303 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 DRD2P14416 443 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NRIP1P48552 1158 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 POF1BQ8WVV4 589 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ASB11Q8WXH4 323 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms