RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 MADCAM1Q13477 382 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERTAD2Q14140 314 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPK11Q15759 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBBP7Q16576 425 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD55Q3KP44 614 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00483Q53H64 154 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ODF2Q5BJF6 829 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGSF11Q5DX21 431 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM219BQ5XKK7 198 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOB1BQ7L9L4 216 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRUNE1Q86TP1 453 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 KBTBD6Q86V97 674 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLRP14Q86W24 1093 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC63Q8NA47 563 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC1AQ8NC01 280 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 BBS1Q8NFJ9 593 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP61Q8NHU2 1237 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC26Q8TAB7 109 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCFD2Q8WU76 684 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRYGNQ8WXF5 182 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATL1Q8WXF7 558 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYDGFQ969H8 173 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RMI2Q96E14 147 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB3CQ96E17 227 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBN1Q9NPG3 1134 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OPN4Q9UHM6 478 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE10AQ9Y233 779 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRYL1Q9Y2S2 319 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3GLB1Q9Y371 365 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RFNGQ9Y644 331 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOTCH1P46531 2555 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR179Q6PRD1 2367 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLRC5Q86WI3 1866 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A096LNJ9 63 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRABD2BA6NFA1 517 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP27XA6NNY8 438 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 E5RGE8 158 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTDSP2O14595 271 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCD4O14678 606 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 B4GAT1O43505 415 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC2A10O95528 541 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C6orf47O95873 294 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP1P03956 469 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FHP07954 510 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINGO3P0C6S8 592 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SP9P0CG40 484 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PFKFB1P16118 471 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IDSP22304 550 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL8A2P25067 703 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPK4P31152 587 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LONP1P36776 959 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACVR1BP36896 505 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTRLP40313 264 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS9P46781 194 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRIP1P48552 1158 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASCL1P50553 236 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRISP1P54107 249 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTO1P78417 241 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCP2Q13094 533 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 BIRC3Q13489 604 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGISQ16647 500 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCA11PQ4W5N1 156 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf47Q569G3 176 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF311Q5JNZ3 666 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FUT10Q6P4F1 479 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC43A2Q8N370 569 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS35Q8N3Z0 413 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD42Q8N9B4 389 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MDS2Q8NDY4 140 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10H4Q8NGA5 316 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RFFLQ8WZ73 363 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMPDL3AQ92484 453 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP6NLQ92738 828 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGM2Q96G03 612 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MUS81Q96NY9 551 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPIN2AQ99865 258 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARPC5LQ9BPX5 153 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ULBP2Q9BZM5 246 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms