RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 VN1R5Q7Z5H4 357 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 SCAIQ8N9R8 606 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 ZNF740Q8NDX6 193 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 OR5P2Q8WZ92 322 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 TAPBPLQ9BX59 468 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A19Q9HC21 320 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 NDOR1Q9UHB4 597 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 SNX8Q9Y5X2 465 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 DDX5P17844 614 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 DDCP20711 480 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 ACADLP28330 430 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 TPTEP56180 551 aa26.66■■□□□ 1.86
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UBP1-201ENST00000283628 DEFA3P59666 94 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 RHAGQ02094 409 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 HEATR4Q86WZ0 1026 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 PIK3R3Q92569 461 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 RHCGQ9UBD6 479 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 MGAT4BQ9UQ53 548 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 WNT6Q9Y6F9 365 aa26.66■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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UBP1-201ENST00000283628 PDE9AO76083 593 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 SEMA3DO95025 777 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 OSMP13725 252 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 PTPN2P17706 415 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 FUT4P22083 530 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 LIM2P55344 173 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 MEDAGQ5VYS4 303 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 AKAP14Q86UN6 197 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 NUS1Q96E22 293 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 UCK2Q9BZX2 261 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 QPCTLQ9NXS2 382 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 GPR34Q9UPC5 381 aa26.65■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 A0A075B6Q4 140 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 HTR3EA5X5Y0 456 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 HIDE1A8MVS5 230 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP33O14559 1287 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 SNPHO15079 494 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 KCNK2O95069 426 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 ALOX12P18054 663 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 ILKQ13418 452 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 CCDC190Q86UF4 302 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 FAM129CQ86XR2 697 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 SLC38A5Q8WUX1 472 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 ROGDIQ9GZN7 287 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 NEUROD4Q9HD90 331 aa26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
UBP1-201ENST00000283628 TLR4O00206 839 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 SPINT1O43278 529 aa26.64■■□□□ 1.85
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UBP1-201ENST00000283628 TMEM240Q5SV17 173 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 PLPP4Q5VZY2 271 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 NLGN4XQ8N0W4 816 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 OR2L2Q8NH16 312 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 BADQ92934 168 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 NUAK2Q9H093 628 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 REV1Q9UBZ9 1251 aa26.64■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 PRNPP04156 253 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 SCG5P05408 212 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 ADRA2AP08913 450 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 POU1F1P28069 291 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 BMPR1AP36894 532 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 DGKGP49619 791 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 ST8SIA6P61647 398 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 RAET1GQ6H3X3 334 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 ZNF547Q8IVP9 402 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 MMP21Q8N119 569 aa26.63■■□□□ 1.85
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UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa26.63■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 K7ESM1 405 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 FAAHO00519 579 aa26.62■■□□□ 1.85
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UBP1-201ENST00000283628 PAPLNO95428 1278 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 BCHEP06276 602 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 WEE1P30291 646 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.857e-6■■■□□ 16.5
UBP1-201ENST00000283628 SLX4IPQ5VYV7 408 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 ZNF366Q8N895 744 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 CCDC32Q9BV29 185 aa26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
UBP1-201ENST00000283628 RHBGQ9H310 441 aa26.62■■□□□ 1.85
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