RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 RAB8AP61006 207 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DUSP2Q05923 314 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 KEAP1Q14145 624 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MICAQ29983 383 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NUS1Q96E22 293 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MALT1Q9UDY8 824 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CACNA1CQ13936 2221 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 COL6A3P12111 3177 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF197O14709 1029 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZW10O43264 779 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0513O60268 411 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LILRB5O75023 590 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 KCNK2O95069 426 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LATS1O95835 1130 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 EPHX1P07099 455 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 JUNDP17535 347 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CD97P48960 835 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MAPK12P53778 367 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PNLIPRP1P54315 467 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CAMK1Q14012 370 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IRF3Q14653 427 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RFX4Q33E94 735 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ERAP2Q6P179 960 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RELTQ969Z4 430 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BEX2Q9BXY8 128 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CLCA1A8K7I4 914 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PGRMC2O15173 223 aa8.25□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 ST8SIA6P61647 398 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF77Q15935 545 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.25□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 SYT14Q8NB59 555 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SLC38A4Q969I6 547 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 COQ8BQ96D53 544 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DTD2Q96FN9 168 aa8.25□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.25□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.24□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SLC28A2O43868 658 aa8.24□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 CDK1P06493 297 aa8.24□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SP140Q13342 867 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.24□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 DESI1Q6ICB0 168 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FAM129CQ86XR2 697 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.24□□□□□ -1.09
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GINS1-201ENST00000262460 OR8K5Q8NH50 307 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 COL26A1Q96A83 441 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CHFRQ96EP1 664 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IGFLR1Q9H665 355 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.24□□□□□ -1.09
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