RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033158.5

Ubfd1-201, Transcript of Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubfd1, Length 4,849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ankrd37Q569N2 159 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 EdnraQ61614 427 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Asb15Q8VHS6 583 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cyp4f15Q99N18 534 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Isl2Q9CXV0 359 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Serpinb7Q9D695 380 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Dennd6bQ9D9V7 585 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ift43Q9DA69 206 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Isca2Q9DCB8 154 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 B4galt6Q9WVK5 382 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Mbd2Q9Z2E1 414 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm3099J3QPA5 205 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ptpn20O55082 426 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Syngr1O55100 234 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 CmahQ61419 577 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Lpcat4Q6NVG1 524 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Dennd2dQ91VV4 469 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tmem246Q91YV9 403 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Fndc8Q9D2H8 321 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Xpr1Q9Z0U0 695 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Trgv2A2J008 116 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 BC049352E9Q2Z6 85 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Bard1O70445 765 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Mapk14P47811 360 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Rps3P62908 243 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cd300lgQ1ERP8 331 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Lmf1Q3U3R4 574 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cfhr2Q4LDF6 332 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Zpbp2Q6X786 326 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Nadsyn1Q711T7 725 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gpr22Q8BZL4 432 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cpne1Q8C166 536 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Treml1Q8K558 317 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr617Q8VGA1 318 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Isoc1Q91V64 297 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ufsp2Q99K23 461 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Slco1c1Q9ERB5 715 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Yipf7Q9JIM5 254 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 H2afb1S4R1E0 115 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 H2afb3S4R1G7 115 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr1164A2AVT5 326 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 ZxdbA2CE44 873 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm3149E9PW52 257 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 FpgtG5E8F4 590 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm8362K7N6Y6 257 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tk1P04184 233 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 GiprQ0P543 460 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gpr15Q0VDU3 360 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 CishQ62225 257 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gas2l1Q8JZP9 678 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 SdslQ8R238 329 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr48Q8VGN4 301 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Twist2Q9D030 160 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 AcoxlQ9DBS4 632 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Lrp6O88572 1613 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Fam131cA2ADB2 273 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm8220F6YKI2 213 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 ThbdP15306 577 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pabpc2Q62029 628 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Wipi2Q80W47 445 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Nadk2Q8C5H8 452 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Atg12Q9CQY1 141 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pin1Q9QUR7 165 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm5538W4VSP6 401 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Myo5bP21271 1818 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 CerklA2AQH1 525 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 C7D3YXF5 845 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm7970L7N271 213 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm7980L7N471 213 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 PigfO09101 219 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Lefty2P57785 368 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tas2r7P59530 312 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 PepdQ11136 493 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Spire1Q52KF3 598 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Slc39a12Q5FWH7 689 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Map4k2Q61161 821 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Slc35f1Q8BGK5 408 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Trnt1Q8K1J6 434 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 MvdQ99JF5 401 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Q9D112 206 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Rps17P63276 135 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Polr2cP97760 275 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Spag8Q3V0Q6 470 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Enpp3Q6DYE8 874 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Oxa1lQ8BGA9 433 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 DrgxQ8BYH0 263 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Angptl7Q8R1Q3 337 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 GlyatQ91XE0 296 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Camk1Q91YS8 374 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tdp2Q9JJX7 370 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Dusp13Q9QYJ7 198 aa15.97■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Serinc3Q9QZI9 472 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms