RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 PIEZO1Q92508 2521 aa7.58□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 LDB3O75112 727 aa7.57□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 HSD3B2P26439 372 aa7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.24e-7■■□□□ 12.8
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SENP1-210ENST00000552189 ITM2AO43736 263 aa7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 DRD2P14416 443 aa7.57□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.57□□□□□ -1.2
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SENP1-210ENST00000552189 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 TRBC2A0A5B9 178 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 WWP2O00308 870 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 HCN1O60741 890 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 OPN1SWP03999 348 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 CSF2P04141 144 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 PIK3CBP42338 1070 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 CDC42P60953 191 aa7.56□□□□□ -1.2
SENP1-210ENST00000552189 RUNX1T1Q06455 604 aa7.56□□□□□ -1.2
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