RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	FGF5	P12034	268 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AMD1	P17707	334 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ELK4	P28324	431 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	RRM2	P31350	389 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	HADHA	P40939	763 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	STAT5A	P42229	794 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NFE2L1	Q14494	772 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	IL11RA	Q14626	422 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PTPRCAP	Q14761	206 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	METRNL	Q641Q3	311 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00523	Q86TU6	105 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CADM2	Q8N3J6	435 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DTX3	Q8N9I9	347 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SGCD	Q92629	289 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SPATA13	Q96N96	652 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TGM7	Q96PF1	710 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CHID1	Q9BWS9	393 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF358	Q9NW07	568 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF221	Q9UK13	617 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	VWA7	Q9Y334	891 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ISPD	A4D126	451 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MGAT4D	A6NG13	374 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	C2orf81	A6NN90	581 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	EI24	O14681	340 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	UPK1B	O75841	260 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	RASAL1	O95294	804 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PRAMEF1	O95521	474 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GSN	P06396	782 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MSH3	P20585	1137 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CNTF	P26441	200 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ARNT	P27540	789 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GSTM2	P28161	218 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PPP5C	P53041	499 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OLIG2	Q13516	323 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NR6A1	Q15406	480 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6AP1	Q15904	470 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	KCTD11	Q693B1	232 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR2L2	Q8NH16	312 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM63	Q969Q1	353 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CITED4	Q96RK1	184 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	BTBD2	Q9BX70	525 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CD300A	Q9UGN4	299 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0G2JMP0	313 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0X1KG70	313 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR2AG2	A6NM03	316 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM77	I1YAP6	450 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	HDAC3	O15379	428 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	KCNN4	O15554	427 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SLC28A2	O43868	658 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SNAP29	O95721	258 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	CHRNG	P07510	517 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	GSTM1	P09488	218 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF28	P17035	718 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6V1B2	P21281	511 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PSMA3	P25788	255 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	OR3A3	P47888	321 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	SEPHS1	P49903	392 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PPP1CA	P62136	330 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	NAB1	Q13506	487 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	PRPSAP1	Q14558	356 aa		6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
FGD4-215	ENST00000551984	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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