RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF1-208	ENST00000472045	BCKDHA	P12694	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	AK1	P00568	194 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	DIO3	P55073	304 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PTGR1	Q14914	329 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	MAPK11	Q15759	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SLC6A18	Q96N87	628 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CD180	Q99467	661 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	RNF13	O43567	381 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	GSK3B	P49841	420 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ARG2	P78540	354 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045		H7C0S8	307 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF20	P17024	532 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PGC	P20142	388 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PRLHR	P49683	370 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TPMT	P51580	245 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PMS2P3	Q13401	168 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	RIPK1	Q13546	671 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	POMP	Q9Y244	141 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	IFI30	P13284	250 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ATP4B	P51164	291 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PLP2	Q04941	152 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	FAM189A1	O60320	539 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	NOBOX	O60393	691 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	NR1H2	P55055	460 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	FOXK1	P85037	733 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ASB6	Q9NWX5	421 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	RDH16	O75452	317 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	NPPA	P01160	153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PRL	P01236	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CCNO	P22674	350 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	OR2B6	P58173	313 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CCNI	Q14094	377 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	RPE65	Q16518	533 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	GSTM2	P28161	218 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	SLC30A4	O14863	429 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	NUAK1	O60285	661 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IRF1-208	ENST00000472045	CREG1	O75629	220 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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