RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 GSTA1P08263 222 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 HSD17B3P37058 310 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 HERVK_113P63132 956 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ID2Q02363 134 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SGO1Q5FBB7 561 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 LETMD1Q6P1Q0 360 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SLC5A8Q8N695 610 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TRPC4APQ8TEL6 797 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM237Q96Q45 408 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ERVK-6Q9BXR3 956 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CDCP1Q9H5V8 836 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD10Q9NXR5 420 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 EEDO75530 441 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SUPT7LO94864 414 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SLU7O95391 586 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 OTCP00480 354 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 IFNA16P05015 189 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 KRT15P19012 456 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CUL3Q13618 768 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 NR6A1Q15406 480 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 UNC50Q53HI1 259 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF678Q5SXM1 525 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 FRG2Q64ET8 278 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 GRHL3Q8TE85 626 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 FRG2BQ96QU4 278 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ESPL1Q14674 2120 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 BSGP35613 385 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CLCQ05315 142 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 STX4Q12846 297 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 IFT88Q13099 833 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 GGTA1PQ4G0N0 100 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TDRPQ86YL5 185 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 APCDD1LQ8NCL9 501 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 B3GNT7Q8NFL0 401 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 OR2W6PQ8NHA6 318 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ADAP2Q9NPF8 381 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ABI3Q9P2A4 366 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 DCDC2Q9UHG0 476 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 EMCNQ9ULC0 261 aa27.36■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 GABRR3A8MPY1 467 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 OR4F21O95013 312 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TUBA3CQ13748 450 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 C18orf63Q68DL7 685 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TUBA3EQ6PEY2 450 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 GPR180Q86V85 440 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CNPY4Q8N129 248 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SUN3Q8TAQ9 357 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SERPINI1Q99574 410 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ELOVL6Q9H5J4 265 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PPCSQ9HAB8 311 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PSD3Q9NYI0 1048 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF225Q9UK10 706 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ATG4BQ9Y4P1 393 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TMPRSS11DO60235 418 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 GLRA3O75311 464 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 GBAP04062 536 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TERF2Q15554 542 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SH2D5Q6ZV89 423 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 OR4N5Q8IXE1 308 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 NCLNQ969V3 563 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 DEFB126Q9BYW3 111 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PHF11Q9UIL8 331 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PPT2Q9UMR5 302 aa27.34■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 A0A0A6YYD5 115 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ESPNB1AK53 854 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PRAMEF2O60811 474 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 IMPDH1P20839 514 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CD96P40200 585 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CLCN2P51788 898 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 ARFIP1P53367 373 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 PRKAA2P54646 552 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 TNFRSF17Q02223 184 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.976e-7■□□□□ 9.8
FBXO18-208ENST00000470089 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 CYP20A1Q6UW02 462 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 FAM180AQ6UWF9 173 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 SLC22A9Q8IVM8 553 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 VMP1Q96GC9 406 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FBXO18-208ENST00000470089 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms