RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PLPP1O14494 284 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 F10P00742 488 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 DCTP40126 519 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ARFIP1P53367 373 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS13P62277 151 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAF3Q13114 568 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MEP1AQ16819 746 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CRLF3Q8IUI8 442 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 BEST3Q8N1M1 668 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 NPAS2Q99743 824 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 10.6
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PPCSQ9HAB8 311 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PSD3Q9NYI0 1048 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ABI3Q9P2A4 366 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 TBK1Q9UHD2 729 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PPT2Q9UMR5 302 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SVILO95425 2214 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 A8MUA0 341 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA8RI6L899 631 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CTNSO60931 367 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO1DO94832 1006 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CLDN1O95832 211 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 OTCP00480 354 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SHBGP04278 402 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PYGBP11216 843 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 TAC1P20366 129 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP2R1BP30154 601 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 HERVK_113P63132 956 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CUL3Q13618 768 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 INAQ16352 499 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 GGTA1PQ4G0N0 100 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 FRG2Q64ET8 278 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CLNKQ7Z7G1 428 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF2BQ8N4N8 673 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 B3GNT7Q8NFL0 401 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SUN3Q8TAQ9 357 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 GRHL3Q8TE85 626 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 FRG2BQ96QU4 278 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK-6Q9BXR3 956 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAP2Q9NPF8 381 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MAN1A2O60476 641 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAMEF2O60811 474 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ETHE1O95571 254 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 GSTA1P08263 222 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 CPN2P22792 545 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 NEK2P51955 445 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 STX4Q12846 297 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SLAMF1Q13291 335 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 NR6A1Q15406 480 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MILR1Q7Z6M3 343 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 TDRPQ86YL5 185 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 OR4F6Q8NGB9 312 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINI1Q99574 410 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 MS4A12Q9NXJ0 267 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 PHF11Q9UIL8 331 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXW2Q9UKT8 454 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-205ENST00000444916 FBN2P35556 2912 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0A6YYD5 115 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GTL3 188 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 GABRR3A8MPY1 467 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CDK2AP1O14519 115 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 DLX3O60479 287 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA3DO95025 777 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CBX6O95503 412 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 IFNA16P05015 189 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 BSGP35613 385 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SLCO1A2P46721 670 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CLCN2P51788 898 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CDH13P55290 713 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFRSF17Q02223 184 aa13.2□□□□□ -0.3
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