RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf172C9J069 976 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C9JVG2 144 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 G3V2T6 193 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BSA7 217 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCR6O00574 342 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FFAR3O14843 346 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD28O15084 1053 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOX3O15254 700 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR42O15529 346 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 E2F6O75461 281 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS23O95084 383 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH8O95206 1070 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CST1P01037 141 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CSF2P04141 144 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PGRP06401 933 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NCK1P16333 377 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT1A6P19224 532 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT1A1P22309 533 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT1A4P22310 534 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AOAHP28039 575 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 VIPR1P32241 457 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT1A3P35503 534 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ASMTP46597 345 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CD97P48960 835 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HLCSP50747 726 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSFP54793 590 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GABARAPL2P60520 117 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL7P80098 99 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CARD16Q5EG05 197 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FHL5Q5TD97 284 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPJQ5W064 366 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF773Q6PK81 442 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 USP51Q70EK9 711 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 STK32CQ86UX6 486 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PARGQ86W56 976 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HORMAD1Q86X24 394 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DTX1Q86Y01 620 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N3U1 123 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FIG4Q92562 907 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2H4Q92759 462 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NAT6Q93015 286 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TMBIM1Q969X1 311 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ESAMQ96AP7 390 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TESCQ96BS2 214 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL8Q96CD0 374 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BMFQ96LC9 184 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX37Q96LM6 180 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF583Q96ND8 569 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GULP1Q9UBP9 304 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf18Q9UK00 162 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 APCP25054 2843 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GTL3 188 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQM1 296 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR19A6NJB7 356 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 K7EM74 188 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2B11O75310 529 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNDBP1O95273 360 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP9O95302 570 aa6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CATP04040 527 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKAR1AP10644 381 aa6.72□□□□□ -1.33
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