RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF358Q9NW07 568 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 SPACA6W5XKT8 324 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 PTPN13Q12923 2485 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 BLACEA4D250 179 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 GABRR3A8MPY1 467 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 CYR61O00622 381 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 E2F3O00716 465 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 MYO1DO94832 1006 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 RASAL1O95294 804 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.33■□□□□ 0.85
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SLC35A3-211ENST00000638876 TUBA3CQ13748 450 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF766Q5HY98 468 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.33■□□□□ 0.85
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SLC35A3-211ENST00000638876 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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SLC35A3-211ENST00000638876 TAAR6Q96RI8 345 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 CSF3RQ99062 836 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 OR51B5Q9H339 312 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 XPR1Q9UBH6 696 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC35A3-211ENST00000638876 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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SLC35A3-211ENST00000638876 MAN1A2O60476 641 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CTNSO60931 367 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SMIM24O75264 130 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SH3BGRLO75368 114 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SCELO95171 688 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CD96P40200 585 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SSR2P43308 183 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 RAP1GDS1P52306 607 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 OR1C1Q15619 314 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 NR4A3Q92570 626 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 H0YIV9 168 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 STX16O14662 325 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 DDAH2O95865 285 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CD46P15529 392 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CLCN2P51788 898 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 MDS2Q8NDY4 140 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 RGMAQ96B86 450 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 PHF21BQ96EK2 531 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 C5orf34Q96MH7 638 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 RIPK2O43353 540 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 IFNA16P05015 189 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 ARFIP1P53367 373 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 MLF1P58340 268 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 STX4Q12846 297 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 MTBPQ96DY7 904 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC35A3-211ENST00000638876 VMP1Q96GC9 406 aa20.3■□□□□ 0.84
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