RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 RNF214Q8ND24 703 aa16.75■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa16.75■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.75■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.74■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2ADP20671 130 aa16.74■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.74■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.74■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.74■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.74■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16.74■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 SACM1LQ9NTJ5 587 aa16.74■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.74■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 P04436 131 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 HK2P52789 917 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 BTN3A2P78410 334 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 REEP5Q00765 189 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 KIF5AQ12840 1032 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.73■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 SPATA3Q8NHX4 192 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 ARL15Q9NXU5 204 aa16.73■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.72■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.72■□□□□ 0.27
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UBE2C-208ENST00000617055 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.72■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 CD53P19397 219 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 PCSK6P29122 969 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 CCZ1BP86790 482 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 RUNX2Q13950 521 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.71■□□□□ 0.27
UBE2C-208ENST00000617055 OPN5Q6U736 354 aa16.71■□□□□ 0.27
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