RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ISCA2	Q86U28	154 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC34A3	Q8N130	599 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MDS2	Q8NDY4	140 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFT81	Q8WYA0	676 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RELT	Q969Z4	430 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCMH1	Q96GD3	660 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS11	Q9H270	941 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	LYRM4	Q9HD34	91 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNX15	Q9NRS6	342 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	DAPP1	Q9UN19	280 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPN13	Q12923	2485 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC19A2	O60779	497 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZG16	O60844	167 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLHL2	O95198	593 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TGFB1	P01137	390 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF224	P0DH78	156 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABO	P16442	354 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF24	P17028	368 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPN2	P22792	545 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MST1	P26927	711 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP2R1B	P30154	601 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CASP2	P42575	452 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINB9	P50453	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSR4	P51571	173 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TDGF1P3	P51864	188 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMS	P52788	366 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	BIK	Q13323	160 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSDL2	Q6YN16	418 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SHISA5	Q8N114	240 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MORN4	Q8NDC4	146 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASB15	Q8WXK1	588 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCLN	Q969V3	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RGMA	Q96B86	450 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ART5	Q96L15	291 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPR137	Q96N19	417 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	QRFPR	Q96P65	431 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	FMO2	Q99518	471 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHF11	Q9UIL8	331 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197		A8MVJ9	347 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	C4orf51	C9J302	202 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRRG2	O14669	202 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NME2P1	O60361	137 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAN1A2	O60476	641 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGDH	O60701	494 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM24	O75264	130 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SH3BGRL	O75368	114 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITGA10	O75578	1167 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACSL3	O95573	720 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN1	O95832	211 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1QA	P02745	245 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBP1	P09455	135 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NME2	P22392	152 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77

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