RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587563.5

RPRD1A-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 643 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-205	ENST00000587563	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LRP4	O75096	1905 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563		A6NCN8	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SNX2	O60749	519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM63A	O94886	807 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CPNE6	O95741	557 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC4A1	P02730	911 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KIT	P10721	976 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	THRA	P10827	490 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LIPC	P11150	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ACP5	P13686	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TPSB2	P20231	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PAX7	P23759	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	IVD	P26440	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ACTR1B	P42025	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MAGEA6	P43360	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GPR1	P46091	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NPY2R	P49146	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BLK	P51451	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	STC1	P52823	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LIMK2	P53671	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ITGA8	P53708	1063 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	UCN	P55089	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GFER	P55789	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ACTR1A	P61163	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CDK16	Q00536	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CDH17	Q12864	832 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NFATC2	Q13469	925 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	POU6F1	Q14863	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NR1D2	Q14995	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRADD	Q15628	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SNF8	Q96H20	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	COX14	Q96I36	57 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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