RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530449.1

TCIRG1-211, Transcript of T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCIRG1, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1-211ENST00000530449 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 HSF1Q00613 529 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CHIT1Q13231 466 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 LAPTM5Q13571 262 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 XKRXQ6PP77 449 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CCDC25Q86WR0 208 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 PPM1NQ8N819 430 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 F2RL3Q96RI0 385 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CD244Q9BZW8 370 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ALG9Q9H6U8 611 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 PRDM7Q9NQW5 492 aa20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CACNA1CQ13936 2221 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ZNHIT1O43257 154 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ITGA10O75578 1167 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TFEBP19484 476 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 HTR1EP28566 365 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MAGEA4P43358 317 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MEOX1P50221 254 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 IRF8Q02556 426 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CAV1Q03135 178 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TGM3Q08188 693 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 DLG1Q12959 904 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 E2F2Q14209 437 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SLMAPQ14BN4 828 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TBCCQ15814 346 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ISCA2Q86U28 154 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TMEM156Q8N614 296 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MEMO1Q9Y316 297 aa20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CTNSO60931 367 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ABOP16442 354 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TNFRSF8P28908 595 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CASQ1P31415 396 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 STX2P32856 288 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CASP2P42575 452 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MSH2P43246 934 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 RCN2Q14257 317 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TRADDQ15628 312 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 RAPH1Q70E73 1250 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SULF2Q8IWU5 870 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 FBF1Q8TES7 1133 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 KCNC2Q96PR1 638 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CCDC77Q9BR77 488 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MS4A8Q9BY19 250 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 RAB17Q9H0T7 212 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ENO4A6NNW6 628 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SUPT3HO75486 399 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ZFAND5O76080 213 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 IFNA16P05015 189 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 AGAP20933 346 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 PTGER1P34995 402 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SSR4P51571 173 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 SMSP52788 366 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.822e-11■■■□□ 16.8
TCIRG1-211ENST00000530449 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 LYRM4Q9HD34 91 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 CHST11Q9NPF2 352 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 APCP25054 2843 aa20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1-211ENST00000530449 TMEM200CA6NKL6 621 aa20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 UBXN8O00124 270 aa20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 PEX1O43933 1283 aa20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 KERAO60938 352 aa20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 CRABP2P29373 138 aa20.14■□□□□ 0.81
TCIRG1-211ENST00000530449 RFC3P40938 356 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms