RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CYR61O00622 381 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CLGNO14967 610 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 OR2J2O76002 312 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 IFNA16P05015 189 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CCDC166P0CW27 439 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SSTR1P30872 391 aa15.74■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 DOC2AQ14183 400 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 OR4D1Q15615 310 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 XKR6Q5GH73 641 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CD163Q86VB7 1156 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.74■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 KRT12Q99456 494 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 EHD1Q9H4M9 534 aa15.74■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 DEPPQ9NTK1 212 aa15.74■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 STK16O75716 305 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 TUBB4AP04350 444 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 CD22P20273 847 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PDK4Q16654 411 aa15.73■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SULT1C3Q6IMI6 304 aa15.73■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 ASB15Q8WXK1 588 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.73■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.73■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.73■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PINLYPA6NC86 204 aa15.72■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 OR6B1O95007 311 aa15.72■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 KRTAP10-9P60411 292 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0D1P61421 351 aa15.72■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 RCN2Q14257 317 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.72■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 WDR34Q96EX3 536 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 RBBP8Q99708 897 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CPNE1Q99829 537 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.72■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 HPF1Q9NWY4 346 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CD274Q9NZQ7 290 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1CQ13936 2221 aa15.72■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 EPORP19235 508 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GMPRP36959 345 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SOX3P41225 446 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 IRF8Q02556 426 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 STX4Q12846 297 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CHIT1Q13231 466 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 HSDL2Q6YN16 418 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.71■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.71■□□□□ 0.11
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