RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-227	ENST00000470563	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-227	ENST00000470563	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-227	ENST00000470563	AFF2	P51816	1311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-227	ENST00000470563	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	INSIG1	O15503	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SNX3	O60493	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ATP5H	O75947	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OLFM2	O95897	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	AGT	P01019	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KRT14	P02533	472 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UROS	P10746	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	EPHA2	P29317	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MNDA	P41218	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCNG1	P51959	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZXDB	P98169	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CACNG1	Q06432	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	COASY	Q13057	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLIT2	O94813	1529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BCL9	O00512	1426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		F8VZ95	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RAD51C	O43502	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GSR	P00390	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ALPL	P05186	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KRT19	P08727	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NEFH	P12036	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CD59	P13987	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PAX1	P15863	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	VCL	P18206	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PSMB4	P28070	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	HTR6	P50406	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PDIA5	Q14554	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MARK4	Q96L34	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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