RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 RYKP34925 604 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RPS6KA3P51812 740 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PLA2G16P53816 162 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CLDN2P57739 230 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DSTNP60981 165 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ISL1P61371 349 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IFI44LQ53G44 452 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLC30A8Q8IWU4 369 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TAMM41Q96BW9 452 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GDF15Q99988 308 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LRIT2A6NDA9 550 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 JRKO75564 520 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 BCL6P41182 706 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SSR2P43308 183 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PMS2P3Q13401 168 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SETD9Q8NE22 299 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NEURL3Q96EH8 262 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 M0QX08 132 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 GSTM2P28161 218 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 LTBRP36941 435 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 GABARAPL2P60520 117 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 NFATC4Q14934 902 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RAB39AQ14964 217 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 NEDD8Q15843 81 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SAXO2Q658L1 398 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 OR2L3Q8NG85 312 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF347Q96SE7 839 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 KRT84Q9NSB2 600 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 A0A0A6YYD5 115 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 A0A0G2JN53 185 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ABCB7O75027 752 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RRM2P31350 389 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 KEAP1Q14145 624 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 FAHD1Q6P587 224 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PDXPQ96GD0 296 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 C5AR2Q9P296 337 aa16.33■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 COL4A2P08572 1712 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 F5P12259 2224 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HAT1O14929 419 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ADAMDEC1O15204 470 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CPNE6O95741 557 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CYP4B1P13584 511 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PCSK6P29122 969 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CMPK1P30085 196 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 IL5RAQ01344 420 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HSPB3Q12988 150 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RAPSNQ13702 412 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZIC1Q15915 447 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 AMER3Q8N944 861 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ISOC1Q96CN7 298 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 WDR92Q96MX6 357 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms