RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CLDN4O14493 209 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 OTCP00480 354 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 CLCQ05315 142 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC13A2Q13183 592 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 RASA2Q15283 850 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 IGFBP7Q16270 282 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-202ENST00000425695 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-202ENST00000425695 CAVIN3Q969G5 261 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-202ENST00000425695 CENPKQ9BS16 269 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 EPS8L2Q9H6S3 715 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 PLA2G3Q9NZ20 509 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 KCMF1Q9P0J7 381 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-202ENST00000425695 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-202ENST00000425695 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa23.45■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 PLPP1O14494 284 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ETHE1O95571 254 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDT17P0C025 328 aa23.45■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 PRKAA2P54646 552 aa23.45■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 FRG2Q64ET8 278 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 LETMD1Q6P1Q0 360 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 IGFL2Q6UWQ7 119 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC22A9Q8IVM8 553 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 Q8NA96 180 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJB14Q8TBM8 379 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CNDP1Q96KN2 507 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 FRG2BQ96QU4 278 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 LMF1Q96S06 567 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNK13Q9HB14 408 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 LYRM4Q9HD34 91 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 NBASA2RRP1 2371 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TGFBR3LH3BV60 316 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 COPEO14579 308 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4F21O95013 312 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 F10P00742 488 aa23.44■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 CRHR1P34998 444 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC26A5P58743 744 aa23.44■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 EXT1Q16394 746 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 FCRLBQ6BAA4 426 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 M1APQ8TC57 530 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 G3V2L1 256 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 PPP2R1BP30154 601 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX11P35716 441 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCAB3Q8N7B9 438 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNYL1Q8N7R7 359 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ELOVL6Q9H5J4 265 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF225Q9UK10 706 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-202ENST00000425695 SPACA6W5XKT8 324 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 PLIN3O60664 434 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 EEDO75530 441 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SCELO95171 688 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF33BQ06732 778 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CUL3Q13618 768 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 GGTA1PQ4G0N0 100 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ZYG11AQ6WRX3 759 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 Q6ZS92 163 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINI1Q99574 410 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP25Q9NPA2 562 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 STMN3Q9NZ72 180 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP10Q9P2G4 905 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CLDN16Q9Y5I7 305 aa23.42■■□□□ 1.34
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