RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ABHD18Q0P651 414 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf111Q8N326 155 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 BMFQ96LC9 184 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF145Q96MT1 663 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RHBGQ9H310 441 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 GHITMQ9H3K2 345 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 REEP4Q9H6H4 257 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 NTN4Q9HB63 628 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 AHSPQ9NZD4 102 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB26Q9ULW5 256 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ICKQ9UPZ9 632 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 POLHQ9Y253 713 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM77I1YAP6 450 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CLIC1O00299 241 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 YY2O15391 372 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SCELO95171 688 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 APBB3O95704 486 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 MT-ND1P03886 318 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CKMT2P17540 419 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINB1P30740 379 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TAS2R50P59544 299 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNC4Q03721 635 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC14A1Q13336 389 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 MS4A8Q9BY19 250 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SP140LQ9H930 580 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 MYNNQ9NPC7 610 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 EBF1Q9UH73 591 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.55□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 LRP4O75096 1905 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 KRBA1A5PL33 1030 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CLOCKO15516 846 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 OR1F1O43749 312 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SEMA3DO95025 777 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RASGRP1O95267 797 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ENGP17813 658 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTR1BP42025 376 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 GZMMP51124 257 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTR1AP61163 376 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKCQQ04759 706 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CHRNB3Q05901 458 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 C2orf80Q0P641 193 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TDGQ13569 410 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO30Q8TB52 745 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PPCDCQ96CD2 204 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 COQ8BQ96D53 544 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CHID1Q9BWS9 393 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 SPASTQ9UBP0 616 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIOO75962 3097 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 H0YJX3 145 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 MAN2B1O00754 1011 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 PLPP1O14494 284 aa9.54□□□□□ -0.88
LRRTM4-202ENST00000409093 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms