RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 LIM2P55344 173 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD17B7P56937 341 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX8P57073 446 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLAMF1Q13291 335 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CPZQ66K79 652 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HDXQ7Z353 690 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT13Q86X67 352 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 EXD3Q8N9H8 876 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 AGAP11Q8TF27 550 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF11Q9UIL8 331 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF225Q9UK10 706 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GTL3 188 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PLPP1O14494 284 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PDYNP01213 254 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ALPPP05187 535 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G2AP14555 144 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CREB1P16220 341 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGA3P26006 1051 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH3A1P30838 453 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RHAGQ02094 409 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CHAF1BQ13112 559 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNT16Q8N428 558 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF175Q8N4F7 328 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C8orf44Q96CB5 159 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR83Q9NYM4 423 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SCN2AQ99250 2005 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NL46 340 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM227AF5H4B4 570 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 BIRC5O15392 142 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 NPHS1O60500 1241 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GUCY1B2O75343 617 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM4O75871 244 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJB5O75953 348 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CHEK2O96017 543 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 BPGMP07738 259 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 COX6A1P12074 109 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CPN2P22792 545 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PGDP52209 483 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4D2P58180 307 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC13A2Q13183 592 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LY6DQ14210 128 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MYBPC3Q14896 1274 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR180Q86V85 440 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HPS6Q86YV9 775 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 LPAR4Q99677 370 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR41Q9HAD4 459 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.47□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CYR61O00622 381 aa14.46□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNSO60931 367 aa14.46□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ETHE1O95571 254 aa14.46□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINA7P05543 415 aa14.46□□□□□ -0.09
PGGT1B-202ENST00000379615 UROSP10746 265 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms