RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RFXANKO14593 260 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA12O60330 932 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RAMP2O60895 175 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA3DO95025 777 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C1QBP02746 253 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SEMG1P04279 462 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4B1P13584 511 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RAB6AP20340 208 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HOXA9P31269 272 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC12P31275 282 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR3A3P47888 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GZMMP51124 257 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42P60953 191 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GALK2Q01415 458 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DSC2Q02487 901 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 VMACQ2NL98 169 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BCL7AQ4VC05 210 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ESCO2Q56NI9 601 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MON1AQ86VX9 555 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RDH10Q8IZV5 341 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LIX1Q8N485 282 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ENKURQ8TC29 256 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ULK4Q96C45 1275 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AP2M1Q96CW1 435 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 COQ7Q99807 217 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA3CQ99985 751 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RASSF1Q9NS23 344 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EXD2Q9NVH0 621 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SCML2Q9UQR0 700 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.9□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR51F1A6NGY5 319 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 H7C0S8 307 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FFAR2O15552 330 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0513O60268 411 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HCN1O60741 890 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SNAPC5O75971 98 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 OR4Q2P0C623 313 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 PRPS1L1P21108 318 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MYL9P24844 172 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TNFSF8P32971 234 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 KDELR2P33947 212 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 AGTR2P50052 363 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ARPP19P56211 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 UBE3AQ05086 875 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 MAP4K2Q12851 820 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FAPQ12884 760 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 IRF3Q14653 427 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CARD16Q5EG05 197 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CEP78Q5JTW2 689 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RNLSQ5VYX0 342 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 BICRALQ6AI39 1079 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 HSDL2Q6YN16 418 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-201ENST00000372616 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.89□□□□□ -1.31
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