RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA7P48741 367 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 MTTPP55157 894 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 LIM2P55344 173 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 BMPR2Q13873 1038 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 GPSM1Q86YR5 675 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 DAPP1Q9UN19 280 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 OTOGQ6ZRI0 2925 aa18.25■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CSMD1Q96PZ7 3565 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 A8MVJ9 347 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 OR2J2O76002 312 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 TUBB4AP04350 444 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 IFNA16P05015 189 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SSTR1P30872 391 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PAFAH1B1P43034 410 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CBLBQ13191 982 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 DOC2AQ14183 400 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 RCN2Q14257 317 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 XKR6Q5GH73 641 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SULT1C3Q6IMI6 304 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SNX31Q8N9S9 440 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PSD4Q8NDX1 1056 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 OR52N2Q8NGI0 321 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 KRT12Q99456 494 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 DEPPQ9NTK1 212 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 HPF1Q9NWY4 346 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 HRH3Q9Y5N1 445 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA1CQ13936 2221 aa18.24■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CTNSO60931 367 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 STK16O75716 305 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PDE9AO76083 593 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CD1DP15813 335 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V0D1P61421 351 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 TGM3Q08188 693 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 OR4D1Q15615 310 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PDK4Q16654 411 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CDKL4Q5MAI5 379 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 BBOF1Q8ND07 529 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ASB15Q8WXK1 588 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CDKL2Q92772 493 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 WDR34Q96EX3 536 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 F2RL3Q96RI0 385 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ENKD1Q9H0I2 346 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PLSCR2Q9NRY7 297 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CD274Q9NZQ7 290 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 MYOTQ9UBF9 498 aa18.23■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 WWP2O00308 870 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 OR6B1O95007 311 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 STMN1P16949 149 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CD22P20273 847 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 STX4Q12846 297 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 HSDL2Q6YN16 418 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 MORN4Q8NDC4 146 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 C14orf79Q96F83 325 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 GPR22Q99680 433 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 RBBP8Q99708 897 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CPNE1Q99829 537 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB127Q9H1M4 99 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SAYSD1Q9NPB0 183 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.22■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 PINLYPA6NC86 204 aa18.21■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 EPORP19235 508 aa18.21■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 SOX3P41225 446 aa18.21■□□□□ 0.51
CXCL3-201ENST00000296026 KCNC1P48547 511 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms