RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM74Q96NL1 305 aa22.65■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52E6Q96RD3 313 aa22.65■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.65■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJB6O75190 326 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STAMBPO95630 424 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SSR2P43308 183 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSD11B2P80365 405 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MC1RQ01726 317 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RABL3Q5HYI8 236 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA24Q86W54 205 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC74BQ96LY2 380 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CGREF1Q99674 301 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CERS1P27544 350 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C21orf58P58505 322 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTN3A2P78410 334 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAF11Q15544 211 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4D9Q8NGE8 314 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC41A2Q96JW4 573 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AHSPQ9NZD4 102 aa22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRP3O75074 770 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARL4DP49703 201 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAS2R50P59544 299 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHFR2Q86XF0 187 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 D2HGDHQ8N465 521 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UCN3Q969E3 161 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CENPKQ9BS16 269 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0A6YYD5 115 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C8BP07358 591 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL1RNP18510 177 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASMTP46597 345 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSK3BP49841 420 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN6P56747 220 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIPEQ05469 1076 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB134Q4QY38 66 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUDT13Q86X67 352 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMIM10Q96HG1 83 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNC2Q96PR1 638 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNH6Q9H252 994 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RMND5AQ9H871 391 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BATF3Q9NR55 127 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDP2Q9P2J9 529 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 D6RAR5 112 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC34A2O95436 690 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACADSP16219 412 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHC1P78364 1004 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPY19L1Q2PZI1 675 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PGS1Q32NB8 556 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDSS2Q86YH6 399 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STARD8Q92502 1023 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF570Q96NI8 536 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MUC13Q9H3R2 512 aa22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALG2Q9H553 416 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms