RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GsrP47791 500 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wbp2P97765 261 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrsn1P97799 196 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TceancQ3US16 359 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 JrkQ60976 557 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp180Q6NZI9 655 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc39a10Q6P5F6 833 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr75Q6X632 540 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dapk2Q8VDF3 370 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr666Q8VH00 318 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpe65Q91ZQ5 533 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt88Q9CPR6 171 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ska1Q9CPV1 254 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RhouQ9EQT3 261 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AgkQ9ESW4 421 aa12.34□□□□□ -0.43
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd300ld2A2A7W0 305 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5938A2AEN9 163 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rex2A2AWF2 685 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf11A6H5X4 337 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20431E9PY39 371 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klf10O89091 479 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01810 119 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd3gP11942 182 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HexaP29416 528 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubfd1Q78JW9 368 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Txndc11Q8K2W3 948 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx11Q91WL6 271 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap1m2Q9WVP1 423 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd13bQ5F259 626 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xrcc1Q60596 631 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OmpQ64288 163 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekhm3Q8BM47 761 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CcinQ8CDE2 588 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sirt5Q8K2C6 310 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsmce2Q91VT1 247 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mlf2Q99KX1 247 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl7aQ9CXE2 210 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gmeb1Q9JL60 562 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp22A8R0V4 111 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C6E9Q6D8 931 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TpmtO55060 240 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bard1O70445 765 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr301Q7TS04 311 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gen1Q8BMI4 908 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8C0X8 640 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Coq9Q8K1Z0 313 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgpra1Q91WW5 304 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nt5c1bQ91YE9 573 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pop7Q9DCH2 140 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Espl1P60330 2118 aa12.33□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chrm4P32211 479 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grik2P39087 908 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamts8P57110 905 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc23a3Q60850 611 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grid2Q61625 1007 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efr3aQ8BG67 819 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trnt1Q8K1J6 434 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl49Q9CQ40 166 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmgn3Q9DCB1 99 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16506F7ANP4 213 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r168K7N6B6 309 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ido1P28776 407 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec1P97353 368 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 UqcrhP99028 89 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpgs2Q66JT5 296 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb1c1Q7M742 95 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr845Q7TRG2 312 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3h14Q8BJ05 735 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crispld1Q8CGD2 500 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr617Q8VGA1 318 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr380Q8VGT3 311 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgre4Q91ZE5 689 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbll1Q9JIY2 491 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tubd1Q9R1K7 455 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CcniQ9Z2V9 377 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttll2A4Q9E4 540 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13285B1AYI3 182 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13275B1AYI8 182 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r61L7N2B8 865 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LifP09056 203 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxw18Q3TSA9 469 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taar7fQ5QD08 358 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taar7bQ5QD11 358 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc5a6Q5U4D8 634 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr699Q7TRN3 316 aa12.32□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Amigo2Q80ZD9 519 aa12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 94.6 ms