RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PdgfdQ925I7 370 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ovca2Q9D7E3 225 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trpv4Q9EPK8 871 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SisF8VQM5 1818 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1253A2AUA2 318 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr564E9PWA8 316 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6811E9Q3Y8 510 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm2888K7N746 267 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8229K7N749 213 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd83O88324 196 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrkcaP20444 672 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gdf7P43029 461 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtf1Q07243 675 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrlrQ08501 608 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lingo4Q149C3 593 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ca4Q64444 305 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5416Q6IE28 97 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc39a4Q78IQ7 660 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Enpp6Q8BGN3 440 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a32Q8BMG8 316 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8C3W1 322 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slfn5Q8CBA2 884 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C1raQ8CG16 707 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Unc5aQ8K1S4 898 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spns1Q8R0G7 528 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DgkgQ91WG7 788 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gjd3Q91YD1 278 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dusp26Q9D700 211 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa9.56□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LctF8VPT3 1931 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NfkbieO54910 364 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtnd2P03893 345 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Man2a1P27046 1150 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NyxP83503 476 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C1orf109Q499E6 217 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rassf5Q5EBH1 413 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mup20Q5FW60 181 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map4k2Q61161 821 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyth4Q80YW0 393 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Peli2Q8BST6 419 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dlgap5Q8K4R9 808 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adgrf1Q8VEC3 908 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr847Q8VFF4 312 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhac1Q91Y10 964 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Med30Q9CQI9 178 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Med18Q9CZ82 208 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata19Q9DAQ9 154 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1040A2ARY1 313 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Morn1A2RTS7 477 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf217D3YYI7 515 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SpxD3Z752 116 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btbd16E9Q173 522 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Catsperg1E9Q355 1151 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6401L7N2C0 213 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a2O55192 617 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ucp2P70406 309 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1318Q7TQW6 320 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbm11Q80YT9 238 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GancQ8BVW0 898 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acsl5Q8JZR0 683 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan33Q8R3S2 283 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1317Q8VF84 316 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lims1Q99JW4 325 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fuca2Q99KR8 461 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gkn2Q9CQS6 184 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc38a3Q9DCP2 505 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SgshQ9EQ08 502 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SrcapA0A087WQ44 3271 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrr1D3YY91 422 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Srp54bE9PXC0 504 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1022L7MTT3 315 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs4O08899 205 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NlkO54949 527 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-AaP01910 256 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RrasP10833 218 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Srp54P14576 504 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FshrP35378 692 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TtlP38585 377 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mapkapk2P49138 386 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lad1P57016 528 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NficP70255 439 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sox9Q04887 507 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MlanaQ2TA50 113 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss53Q571E5 552 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam189bQ5HZJ5 669 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fzd4Q61088 537 aa9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpsf6Q6NVF9 551 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cramp1Q6PG95 1285 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms