RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CGB2Q6NT52 195 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF563Q8TA94 476 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NELL2Q99435 816 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR51E2Q9H255 320 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 IL37Q9NZH6 218 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HES2Q9Y543 173 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM233B4DJY2 109 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ADAM10O14672 748 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TXNL1O43396 289 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RBBP9O75884 186 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TFP02787 698 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ACVR2AP27037 513 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CCL23P55773 120 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NPRL3Q12980 569 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NAE1Q13564 534 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CBFBQ13951 182 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RAB30Q15771 203 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CARD16Q5EG05 197 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF627Q7L945 461 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C12orf29Q8N999 325 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 COL26A1Q96A83 441 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM74Q96NL1 305 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TRIB3Q96RU7 358 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 B3GALT2O43825 422 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SOX30O94993 753 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KAT7O95251 611 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF35P13682 527 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ASPAP45381 313 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GRIK5Q16478 980 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ELP2Q6IA86 826 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TEX19Q8NA77 164 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GPER1Q99527 375 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PSD2Q9BQI7 771 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LTN1O94822 1766 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TCHHQ07283 1943 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 A0A0G2JMP0 313 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SMPD1P17405 629 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EDNRAP25101 427 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CRISP3P54108 245 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OXA1LQ15070 435 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GID4Q8IVV7 300 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KDM1BQ8NB78 822 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MUL1Q969V5 352 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF649Q9BS31 505 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CSN2P05814 226 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GIMD1P0DJR0 217 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CAPN3P20807 821 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 VAMP1P23763 118 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PSMD8P48556 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HK3P52790 923 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LILRA4P59901 499 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CD47Q08722 323 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.8 ms