RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568612.5

VPS35-208, Transcript of VPS35, retromer complex component, humanhuman

TSL 5

Gene VPS35, Length 697 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS35-208ENST00000568612 BFARQ9NZS9 450 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 CDH22Q9UJ99 828 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 SARDHQ9UL12 918 aa3.13□□□□□ -1.91
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VPS35-208ENST00000568612 GPR34Q9UPC5 381 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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VPS35-208ENST00000568612 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.13□□□□□ -1.91
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VPS35-208ENST00000568612 ENGP17813 658 aa3.12□□□□□ -1.91
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VPS35-208ENST00000568612 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 TAB1Q15750 504 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 SLC18A3Q16572 532 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 PDK4Q16654 411 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS35-208ENST00000568612 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.12□□□□□ -1.91
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