RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552599.5

CNOT2-240, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT2, Length 2,360 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-240ENST00000552599 CITED1Q99966 193 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TPPP3Q9BW30 176 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CIPCQ9C0C6 399 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 P2RY12Q9H244 342 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ASB8Q9H765 288 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 A0A1W2PQ67 120 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SOBPA7XYQ1 873 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 GPR171O14626 319 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PCDH17O14917 1159 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 VPS26AO75436 327 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ADH5P11766 374 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ITGB6P18564 788 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CALB2P22676 271 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 THEM4Q5T1C6 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 MTSS1LQ765P7 747 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 LONP2Q86WA8 852 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 DSELQ8IZU8 1212 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SNX31Q8N9S9 440 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TANKQ92844 425 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 FGF13Q92913 245 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 OTUB2Q96DC9 234 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SCRN2Q96FV2 425 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 LYSMD1Q96S90 227 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 GDF15Q99988 308 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 DERL2Q9GZP9 239 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 EBF3Q9H4W6 596 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 HCN2Q9UL51 889 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 E5RI56 91 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 BTN3A1O00481 513 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PPP6CO00743 305 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 DNPH1O43598 174 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 DCXO43602 365 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 MGRN1O60291 552 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TULP3O75386 442 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SUPT3HO75486 399 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ECI2O75521 394 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 LEFTY1O75610 366 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SUPT7LO94864 414 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TGM6O95932 706 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ESR1P03372 595 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CTSLP07711 333 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CISD3P0C7P0 127 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CTRB1P17538 263 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TNFRSF1AP19438 455 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ITGALP20701 1170 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 LCN1P31025 176 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SPAM1P38567 509 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CAPGP40121 348 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 RGS19P49795 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CLCN7P51798 805 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CDH13P55290 713 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PTSQ03393 145 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 RAD51Q06609 339 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 LGALS3BPQ08380 585 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 UNC50Q53HI1 259 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TMEM198Q66K66 360 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 SNX20Q7Z614 316 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ASPGQ86U10 573 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 ZNF596Q8TC21 504 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.12□□□□□ -1.27
CNOT2-240ENST00000552599 GLMPQ8WWB7 406 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms