RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 RNF224P0DH78 156 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CARD16Q5EG05 197 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 HACD4Q5VWC8 232 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TRIQKQ629K1 86 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 NAGSQ8N159 534 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ST8SIA4Q92187 359 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TEPSINQ96N21 525 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 DUSP26Q9BV47 211 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 FICDQ9BVA6 458 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL1Q9NR64 748 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 U3KQV3 271 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 MASP2O00187 686 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 IFNGP01579 166 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 GAAP10253 952 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF250P15622 560 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ARSBP15848 533 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 OAZ1P54368 228 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.056e-12■□□□□ 10.1
GPBP1-208ENST00000514387 MICAQ29983 383 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SPON1Q9HCB6 807 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 VAPAQ9P0L0 249 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TSC2P49815 1807 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CXCL8P10145 99 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 LCP1P13796 627 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CTPS1P17812 591 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 GABRB1P18505 474 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TSPAN8P19075 237 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SDC2P34741 201 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM107Q6UX40 140 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 FAM151AQ8WW52 585 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SOSTQ9BQB4 213 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 GSX2Q9BZM3 304 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 VNN3Q9NY84 501 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SSR3Q9UNL2 185 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 HYKKA2RU49 373 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 LCHNA4D1U4 455 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 E9PAM4 449 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TSPAN19P0C672 248 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 STAG3L1P0CL83 205 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PRG2P13727 222 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PGGT1BP53609 377 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 SLC9A5Q14940 896 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 WBP1Q96G27 269 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 CASD1Q96PB1 797 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 NPAS1Q99742 590 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 MENTQ9BUN1 341 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 MIOSQ9NXC5 875 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 MPP6Q9NZW5 540 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-208ENST00000514387 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms