RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 CD53P19397 219 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ITGAXP20702 1163 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ALAS2P22557 587 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CNTFP26441 200 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 IMPA1P29218 277 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CRABP2P29373 138 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SHMT2P34897 504 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CCNFP41002 786 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 GABRA4P48169 554 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINB8P50452 374 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RAB28P51157 221 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SLC12A2P55011 1212 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ARG2P78540 354 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SP140Q13342 867 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 CSHL1Q14406 222 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 RASA2Q15283 850 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ISCA2Q86U28 154 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 SIAH3Q8IW03 269 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 AMER2Q8N7J2 671 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF480Q8WV37 535 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD7Q92527 254 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 NXNL1Q96CM4 212 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 FOPNLQ96NB1 174 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 OR2A14Q96R47 310 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 TBK1Q9UHD2 729 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 ACOT9Q9Y305 439 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087X1B8 175 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 E7ENX8 843 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 KLHL2O95198 593 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 F10P00742 488 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SBK3P0C264 359 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 PSMB5P28074 263 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TYK2P29597 1187 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SLC26A3P40879 764 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 ATP6V0D1P61421 351 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TAP2Q03519 686 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF844Q08AG5 666 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 RAPH1Q70E73 1250 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 MTBPQ96DY7 904 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 MAGED4Q96JG8 741 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 ZIM3Q96PE6 472 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC77Q9BR77 488 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 VPS11Q9H270 941 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 PARVBQ9HBI1 364 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 STMN3Q9NZ72 180 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 PPT2Q9UMR5 302 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 OARD1Q9Y530 152 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0J9YY10 115 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 ISM1B1AKI9 464 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 GOLGA8RI6L899 631 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 TAPBPO15533 448 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 CDH16O75309 829 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-204ENST00000495399 GUCA1CO95843 209 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms