RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GNLY	P22749	145 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CCNG1	P51959	295 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MTTP	P55157	894 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RAB38	P57729	211 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R50	P59544	299 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RUNX2	Q13950	521 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TLR1	Q15399	786 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	EXT1	Q16394	746 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZS92	163 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GPR78	Q96P69	363 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	LMF1	Q96S06	567 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	OR51B5	Q9H339	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	STMN3	Q9NZ72	180 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQ72	361 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN4	O14493	209 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA16	P05015	189 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	COL6A2	P12110	1019 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEA12	P43365	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RCN2	Q14257	317 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PSMF1	Q92530	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	REPS1	Q96D71	796 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MYO1D	O94832	1006 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	WDPCP	O95876	746 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	MYBL2	P10244	700 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN8	P19075	237 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	TAC1	P20366	129 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB1	P30740	379 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	CASP2	P42575	452 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	LIM2	P55344	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	SLC26A5	P58743	744 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	STX4	Q12846	297 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	NR6A1	Q15406	480 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	ISL2	Q96A47	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	CSF3R	Q99062	836 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19

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