RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 OR2M4Q96R27 311 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 LIME1Q9H400 295 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R14Q9NYV8 317 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 MEMO1Q9Y316 297 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 VIPP01282 170 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 CD63P08962 238 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 FAM69BQ5VUD6 431 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 TDRPQ86YL5 185 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 NIPA2Q8N8Q9 360 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 M0QYV0 167 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 ZMPSTE24O75844 475 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 TTC4O95801 387 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 ACADSBP45954 432 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 PLTPP55058 493 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 LOXL3P58215 753 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00205P59089 165 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 RHOAP61586 193 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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