RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 AZIN1O14977 448 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SCELO95171 688 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 UMODP07911 640 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CYC1P08574 325 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 FOXA1P55317 472 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CDC20Q12834 499 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RUNX2Q13950 521 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 FAM69BQ5VUD6 431 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MED25Q71SY5 747 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CA13Q8N1Q1 262 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ACOT4Q8N9L9 421 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MGARPQ8TDB4 240 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D20Q96BZ9 403 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CRB3Q9BUF7 120 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PRORYQ9H606 182 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 LYRM4Q9HD34 91 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 VPS29Q9UBQ0 182 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 DSPP15924 2871 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 LAMA5O15230 3695 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZZEF1O43149 2961 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PKD1L2Q7Z442 2459 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CDC14CA4D256 554 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH17O14917 1159 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ATP8B1O43520 1251 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJB6O75190 326 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ETHE1O95571 254 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CHEK2O96017 543 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 HEXBP07686 556 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PRKAR1AP10644 381 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 JAK1P23458 1154 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MMP11P24347 488 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 EMP2P54851 167 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 OLR1P78380 273 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 IL10RAQ13651 578 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 LAPTM4BQ86VI4 370 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM42Q8IWZ5 723 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PRSS58Q8IYP2 241 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CLYBLQ8N0X4 340 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 VPS50Q96JG6 964 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 C3orf18Q9UK00 162 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MKL2Q9ULH7 1088 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 EPG5Q9HCE0 2579 aa25.27■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA1BQ00975 2339 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 IDSB3KWA1 339 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 RTCAO00442 366 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CHRNGP07510 517 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 FHP07954 510 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 BSGP35613 385 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 STX3Q13277 289 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TUBB8Q3ZCM7 444 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF793Q6ZN11 406 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 PAGE2Q7Z2X7 111 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM29Q9UKF5 820 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 DAPP1Q9UN19 280 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 POLHQ9Y253 713 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TRAF6Q9Y4K3 522 aa25.26■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CERS1P27544 350 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINB3P29508 390 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 OTX2P32243 289 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 LIM2P55344 173 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 RAB38P57729 211 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MFSD4BQ5TF39 518 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 METTL4Q8N3J2 472 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MS4A12Q9NXJ0 267 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SPACA6W5XKT8 324 aa25.25■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 JRKO75564 520 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA4LO95757 839 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 FURINP09958 794 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 BGNP21810 368 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SLC1A6P48664 564 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 HTR6P50406 440 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 FOXL2P58012 376 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SLAMF1Q13291 335 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MINDY4Q4G0A6 757 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC6AQ6EIG7 209 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 RNF165Q6ZSG1 346 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM46Q7Z4K8 759 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 NUDT13Q86X67 352 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 KIRREL3Q8IZU9 778 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 HBEGFQ99075 208 aa25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 KCMF1Q9P0J7 381 aa25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms