RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS13Q6UX07 377 aa26.01■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX32Q86XE0 403 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX37Q96LM6 180 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf90Q96M02 699 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEPDC7Q96QD5 511 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPACA6W5XKT8 324 aa26.01■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 POU5F2Q8N7G0 328 aa26■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CLMPQ9H6B4 373 aa26■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXW2Q9UKT8 454 aa26■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COX7A2P14406 83 aa25.99■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR180Q86V85 440 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R3BQ86XI6 285 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 FUNDC1Q8IVP5 155 aa25.99■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 REEP4Q9H6H4 257 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLCA2Q9UQC9 943 aa25.99■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DYTNA2CJ06 578 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERICH4A6NGS2 130 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC154A6NI56 674 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BMH7 237 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGK494L7N484 410 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF749O43361 778 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALAS2P22557 587 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL12AP29459 219 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MNAT1P51948 309 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 C21orf58P58505 322 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DPY19L1Q2PZI1 675 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGS1Q32NB8 556 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMEL1Q495T6 779 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTLL10Q6ZVT0 673 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LYRM4Q9HD34 91 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A12Q9NXJ0 267 aa25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB4Q9Y574 426 aa25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CSO75390 466 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IL6P05231 212 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 FTH1P19P0C7X4 201 aa25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RIMKLAQ8IXN7 391 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MVB12AQ96EY5 273 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR41Q9HAD4 459 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPT2O15123 496 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFLARO15519 480 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5HO75947 161 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRD2P14416 443 aa25.97■■□□□ 1.75
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