RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm8897L7N294 181 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r31L7N2F1 303 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CidebO70303 219 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01667 111 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cct8P42932 548 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stard6P59096 233 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ptpn2Q06180 406 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem217Q14AF1 189 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DgkbQ6NS52 802 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gprin3Q8BWS5 763 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nkiras1Q8CEC5 192 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klk6Q91Y82 253 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Med21Q9CQ39 144 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nde1Q9CZA6 344 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem35aQ9D328 167 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Marveld3Q9D956 376 aa19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14147A2AQX6 640 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zp2P20239 713 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MazP56671 477 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fgf14P70379 247 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2-Q6P79568 326 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Crisp1Q03401 244 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccser2Q3UHI0 833 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Itga2Q62469 1178 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Elfn2Q68FM6 823 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 IlvblQ8BU33 632 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 B4gat1Q8BWP8 415 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zbtb49Q8BXX2 756 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ManbaQ8K2I4 879 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arhgef3Q91X46 524 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspa14Q99M31 509 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mri1Q9CQT1 369 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Borcs5Q9D920 195 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plscr1Q9JJ00 328 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adam23Q9R1V7 829 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lhx9Q9WUH2 397 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Unc13cQ8K0T7 2210 aa19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dock6Q8VDR9 2080 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kctd17E0CYQ0 296 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AU018091E9PWS4 684 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prr22F6TNE3 422 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp934K7N6H3 473 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc153P0C7Q1 202 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prim2P33610 505 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Epb41P48193 858 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fmo1P50285 532 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chsy3Q5DTK1 884 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MogQ61885 246 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CishQ62225 257 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kirrel2Q7TSU7 700 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr586Q8VH13 317 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdc42ep1Q91W92 409 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam118aQ91YN1 357 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Khdc3Q9CWU5 440 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttc25Q9D4B2 624 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TrmuQ9DAT5 417 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Panx1Q9JIP4 426 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aqp5Q9WTY4 265 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ak4Q9WUR9 223 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lrp4Q8VI56 1905 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28363A0A087WQW2 129 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 EmdO08579 259 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 F9P16294 471 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 OclnQ61146 521 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxl4Q8BH70 621 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r198Q8R263 300 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Emc7Q9EP72 241 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CtszQ9WUU7 306 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cib1Q9Z0F4 191 aa19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp600A2A7V0 737 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4930595M18RikA2RRY9 829 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ChadlE9Q7T7 748 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm10324L7N208 604 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rem1O35929 297 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DdcO88533 480 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Orm2P07361 207 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fcgr3P08508 261 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GypaP14220 168 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Polr1bP70700 1135 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sema3gQ4LFA9 780 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HhipQ7TN16 700 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf423Q80TS5 1292 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbm11Q80YT9 238 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mief1Q8BGV8 463 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam92aQ8BP22 355 aa19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms