RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.65□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PHLPP1O60346 1717 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CLDN5O00501 218 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SDHDO14521 159 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MT-ND5P03915 603 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GADD45AP24522 165 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF33BQ06732 778 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MSS51Q4VC12 460 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC51AQ86UW1 340 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ANKRD46Q86W74 232 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BEST3Q8N1M1 668 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RHBGQ9H310 441 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ARL5CA6NH57 179 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TOXO94900 526 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NR2C1P13056 603 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ENGP17813 658 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FUT4P22083 530 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF132P52740 706 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SP140Q13342 867 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KCNC3Q14003 757 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SPHARQ15513 63 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF529Q6P280 563 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ARL9Q6T311 187 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CEP68Q76N32 757 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KXD1Q9BQD3 176 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NANOGQ9H9S0 305 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PIK3C2AO00443 1686 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SC5DO75845 299 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 UBBP0CG47 229 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LAMP2P13473 410 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PGAM2P15259 253 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GM2AP17900 193 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MSR1P21757 451 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BRCC3P46736 316 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NRIP1P48552 1158 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DGKGP49619 791 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DUSP4Q13115 394 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF460Q14592 562 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.359e-6■■□□□ 14.4
CLCN3-211ENST00000613795 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RNF130Q86XS8 419 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GHDCQ8N2G8 530 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KCNN1Q92952 543 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR5B12Q96R08 314 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR2M2Q96R28 347 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MMP28Q9H239 520 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR51J1Q9H342 316 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FZD4Q9ULV1 537 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DUXAA6NLW8 204 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 XKRYO14609 159 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF30P17039 623 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CTPS1P17812 591 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HSPA7P48741 367 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RPIAP49247 311 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CDH11P55287 796 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 S100A10P60903 97 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 UFM1P61960 85 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 STK11Q15831 433 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PROX2Q3B8N5 592 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RAB41Q5JT25 222 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 AVPI1Q5T686 147 aa6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.64□□□□□ -1.35
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