RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567306.5

PDXDC1-215, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-215ENST00000567306 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 WDR41Q9HAD4 459 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MYNNQ9NPC7 610 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 AHSPQ9NZD4 102 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MAP10Q9P2G4 905 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A0C4DFX4 3053 aa7.1□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LAMA1P25391 3075 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A088AWK7 358 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DYTNA2CJ06 578 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CPED1A4D0V7 1026 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RASSF9O75901 435 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SCELO95171 688 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MED26O95402 600 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 FURINP09958 794 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LAMP1P11279 417 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 COX7A2P14406 83 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PNLIPP16233 465 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PGM1P36871 562 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KIR3DL1P43629 444 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GABRA4P48169 554 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SLC7A2P52569 658 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MAPK12P53778 367 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PLIN5Q00G26 463 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KLC1Q07866 573 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TCF15Q12870 199 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 NFYCQ13952 458 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KCNAB1Q14722 419 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PGS1Q32NB8 556 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GTDC1Q4AE62 458 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 USP53Q70EK8 1073 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ANKRD46Q86W74 232 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DPP10Q8N608 796 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 FAM13CQ8NE31 585 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 IFI44Q8TCB0 444 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GTF2H4Q92759 462 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 UCN3Q969E3 161 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ROPN1LQ96C74 230 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SMIM10Q96HG1 83 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 QRFPRQ96P65 431 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KCNC2Q96PR1 638 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CD180Q99467 661 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SPSB2Q99619 263 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.09□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms